Bilkent Üniversitesi Uluslararası İlişkiler Bölümü’nden mezun olduktan sonra (2003), yine aynı üniversitenin Tarih Bölümü’nde Prof. Halil İnalcık’ın danışmanlığında 16. Yüzyılda Batı Akdeniz’de Osmanlı korsanları üzerine hazırladığı tezle yüksek lisans derecesini aldı (2006). Doktora çalışmalarını Georgetown Üniversitesi’nde Prof. Gabor Agoston ile Osmanlı-Habsburg rekabeti çerçevesinde 16. Yüzyıl Akdenizi’nde İstihbarat üzerine tamamladı (2012). Journal of Early Modern History, Turkish Historical Review, Acta Orientalia Scientiarum Hungaricum, Journal of Ottoman Studies, Historia Moderna, Mediterranea gibi uluslararası dergilerde yayınladığı makalelerin yanı sıra birçok uluslararası konferansta 16. Yüzyıl Osmanlı ve Akdeniz tarihi üzerine tebliğler vermiştir. Akıcı şekilde İngilizce, Fransızca, İtalyanca ve İspanyolca konuşan Gürkan, ileri seviyede Latince, Osmanlıca, Portekizce ve orta seviyede Almanca ve Farsça bilmektedir.
